价格不同，性能不同，环保性不同，看环保，聚氨酯防水涂料具有有害物质，施工时会挥发出较浓的异味，同时油性防水涂料不溶于水，要用化学液体溶解，也是造成其不环保的原因。
相比，水性的聚合物水泥基防水涂料则不会有这种危害，其性质与水泥接近，环保无毒。
1、分散的介质区别
水性的聚氨酯防水涂料，是使用水来替代有机溶剂，成为分散的介质。而油性的聚氨酯防水涂料，是使用异氰酸酯、聚醚等其它的有机溶液，来成为分散介质。
2、用途上的区别
水性聚氨酯防水涂料，一般是使用在动水地层、土质层、及表层的巩固，和防护作用，可带来不错的效果。而油性聚氨酯防水涂料，通常是用在地基的加工，防护林的水堵工作中。
3、固结体弹性的区别
水性聚氨酯防水涂料，具有的固结体弹性是比较好的，因而可在混凝土动缝进行防渗堵漏的功能。而油性聚氨酯防水涂料，含有的固结性弹性是比较小的，因而被用在混凝土的静缝中，起到防渗堵漏和加固的功能。
